琼脂糖凝胶电泳（Agarose Gel Electrophoresis）是一种常用于生化分析中的手段，主要用于分离和检测DNA、RNA、蛋白质等生物大分子，并可以快速评估其纯度和相对分子量。具体原理为，把样品加入到琼脂糖凝胶中，然后通过电场使其在琼脂糖凝胶中进行分离。在分离的过程中，较小的分子会被电场推动而移动的更快，而较大的分子则移动地相对较慢，从而分离出不同大小的分子。
琼脂糖凝胶电泳除了可以用于生物大分子的分离，还可以用于检测和定量某些物质，有广泛的应用。例如，可作为诊断某些病毒、细菌感染的辅助手段，可作为检测遗传突变的方法或评估基因检测的质量等等。